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农业生物技术国家重点实验室:从耐盐大豆到水稻基因组

科研 约 4,264 字 · 9 分钟 更新

本文为参考区(04 科研)事实型档案,不标可信度徽章,逐项挂学术/官方来源。所涉学者为公开人物,据公开资料据实记名。农业生物技术国家重点实验室概况另见 04-research/state-key-laboratories.md;耐盐大豆专项深考见 04-research/salt-tolerant-soybean.md


一句话定位: 香港中文大学农业生物技术国家重点实验室(SKLA)于2008年获国家科技部批准、以水稻营养强化与大豆基因组研究为核心,是香港高校在国家农业科技体系中最具代表性的伙伴实验室之一。


这所实验室从何而来?

香港中文大学农业生物技术国家重点实验室(State Key Laboratory of Agrobiotechnology,简称 SKLA)的设立,有一条清晰的制度脉络。据 CUHK 官方新闻稿,实验室于 2008年4月2日获得国家科学技术部批准设立,成为中大当时的第二所国家重点实验室(同年,同校转化肿瘤学领域的国重室已于2006年先行批设)。

这一设立并非从零起步。SKLA 的人才与学术根基,来自中大植物及农业生物技术研究所——该研究所在此前已获大学教育资助委员会「卓越学科领域」计划两度资助,合计取得 逾6300万港元(10年期,UGC 卓越学科领域计划,2000年代)的资助支持。这段积累,是 SKLA 申获国家重点实验室资格的重要基础。

实验室正式揭幕为 2008年12月13日


创始团队与主要合作方是谁?

创始期的领导架构,据 CUHK 官方新闻稿如下:

职务 学者 研究方向
创始主任 孙世民教授(Samuel Sun Sai-ming),中国工程院院士 植物基因表达、水稻基因组
创始副主任 林汉明教授(Lam Hon-Ming) 大豆基因组学、功能基因鉴定
现任主任 林汉明教授 大豆基因组、水稻抗病
现任副主任 蒋礼文教授(Liwen Jiang) 植物细胞生物学、蛋白质转运

主要合作单位方面,据官方资料,SKLA 确立了以中国农业大学(China Agricultural University, CAU)为首要大陆伙伴的格局——两校在农业生物技术领域早有合作渊源。此外,据同一来源,实验室还与中国国家杂交水稻工程技术研究中心中国科学院遗传与发育生物学研究所中国农业科学院作物科学研究所中国水稻研究所(杭州)、以及北京大学、清华大学、扬州大学等机构开展合作,国际合作方涵盖美国、英国、日本的研究单位。


SKLA 的三大研究主线是什么?

SKLA 官方网站,实验室当前聚焦三个核心方向:

研究方向 核心议题
气候智慧农业(Climate-Smart Agriculture) 作物基因组、耐逆性、能量转换,应对气候变化下的粮食安全
植物细胞生物学(Plant Cell Biology) 细胞成像、蛋白质运输、细胞器互作、植物生物反应器
农业基因组学(Agrogenomics) 多组学技术、农业遗传资源开发、港内地国际三维合作

这一框架,与建室之初的核心使命一脉相承——据 官方新闻稿援引孙世民教授的表述,实验室的根本目标是「结合传统育种智慧与现代生物技术,培育具有更高产量与营养价值的新水稻品种」,因为水稻是全球约半数人口的主食作物。


水稻营养强化:孙世民团队与 Gates Foundation 的合作

SKLA 早期最受国际关注的研究之一,是水稻赖氨酸营养强化。赖氨酸是水稻种子中含量最低的必需氨基酸,也是以稻米为主食人群营养摄入的主要短板之一。

CUHK 官方新闻稿,SKLA 启动了一项由比尔及梅琳达·盖茨基金会资助、金额达 8800万港元(Bill & Melinda Gates Foundation,2000年代批出)的国际合作研究项目,与来自四个国家的六个实验室联合攻关,目标是提高水稻的营养价值。这一项目,与 SKLA 的合成与功能基因组学平台深度整合,体现了建室之初「依托香港的国际联网优势,联动大陆资源」的制度设计初衷。


林汉明与大豆基因组:从31个基因组到封面文章

大豆方向的突破,由林汉明教授领衔。据 CUHK 生命科学学院,他自 1997年回到中大起便持续深耕大豆耐逆研究,迄今已逾二十年。

2010年的《自然·遗传学》封面文章是这段历程最具里程碑意义的节点。据 发表于 Nature Genetics 的学术论文,林汉明团队联合 BGI(华大基因)对 31个野生与栽培大豆基因组重测序,系统揭示了野生大豆与栽培大豆之间的遗传多样性格局与人工选择痕迹——这是当时规模最大的大豆基因组比较研究之一,成果以封面形式于2010年12月刊出。核心发现是:野生大豆的等位基因多样性显著高于栽培种,意味着驯化过程中人类选择已造成大量遗传资源的流失,而这些「流失」的基因,正是改良现代大豆的潜在宝库。


为什么要给野生大豆测「参考级基因组」?

从31个基因组的群体规律,到一个物种的精密地图——2019年,林汉明团队在基础工程层面又迈出关键一步。

CUHK 官方2019年新闻稿,团队联合 BGI 基因组学等机构,利用第三代测序技术,于 2019年4月3日宣布完成世界首个参考级野生大豆基因组——即野生大豆品系 W05 的染色体级高质量基因组组装,成果同样发表于《自然·通讯》(Nature Communications)。

「参考级」(reference-grade)的价值在于精度:这一基因组在染色体尺度完成组装,可作为后续所有野生大豆基因研究的标准参照物。借助这张「遗传地图」,团队发现了野生与栽培大豆之间一系列重要结构差异,包括第11号与第13号染色体之间的易位事件、以及控制种皮颜色的 I 基因座处的大型基因组倒位——后者正是大豆由「深色种皮」驯化为「黄色种皮」这一驯化之谜的基因学解释。


耐盐基因到底长什么样?

参考级基因组之前,2014年的耐盐基因克隆同样是关键节点。据 2014年《自然·通讯》学术论文,林汉明团队通过全基因组测序,从野生大豆中鉴定并克隆出新型耐盐基因 GmCHX1。GmCHX1 是一个离子转运体基因,推测通过降低细胞内钠/钾比率(Na⁺/K⁺)发挥耐盐功能。这一发现为此后的分子标记辅助育种提供了直接的靶点。


基因组如何变成田里的大豆?

基础研究的最终出口,是可以在土地上生长的作物。据 CUHK 官方特稿,林汉明与甘肃省农业科学院张国宏教授、中国农业科学院邵桂花教授等大陆育种专家合作,运用分子标记与传统育种相结合的方法,成功培育出三个耐盐耐旱大豆品种:陇黄1号、陇黄2号、陇黄3号

品种 特性 推广区域
陇黄1号 耐盐耐旱 甘肃黄土高原旱地
陇黄2号 耐盐耐旱 甘肃黄土高原旱地
陇黄3号 耐盐耐旱 甘肃黄土高原旱地

官方特稿,截至2021年,三个品种在甘肃省黄土高原旱区的推广面积已逾 40,700公顷,横跨约2000公里的旱地区域。研究还延伸至南非,在当地建立了20公顷的试验农场,以协助非洲小农应对粮食安全挑战。


大豆还上过太空?

林汉明团队的研究边界,在2023年延伸到了低地球轨道。据 CUHK 官方新闻稿,2023年5月10日,SKLA 与中国载人航天工程办公室、华润集团科技研究院、神舟生物科技集团合作,将大豆根瘤菌样本随天舟六号货运飞船送入中国空间站天宫——这是香港首个进入太空的农业科研项目。项目目标是通过对比太空内外根瘤菌的基因变异,筛选固氮效率更优的新型菌株,为气候适应型农业开拓前沿思路。


SKLA 在制度上承担什么角色?

SKLA 的设立,折射出香港科研融入国家创新体系的一种路径模式。据 CUHK 官方网站,实验室的制度定位是「伙伴实验室」——以中国农业大学为主要大陆依托单位,把香港在国际联网、人才储备、现代管理方面的优势,与内地在经济规模、科研体量、自然资源方面的优势进行「互补性战略对接」。

这一模式的含义在于:SKLA 不是封闭于香港校园内的地方性研究机构,而是国家农业科技创新网络中的一个节点——它的成果流向甘肃的盐碱地,它的基因组数据向全球科学家开放共享,它的根瘤菌搭乘货运飞船进入中国空间站。

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来源 · 自行复核